Cerca de 12% das crianças apresentam alguma alteração. São as possíveis:
1. Atresia de esôfago - bloqueio para o alimento passar da boca ao estômago
2. Fístula traqueoesofágica - comunicação entre o esôfago e a traquéia que pode levar a tosse, pneumonias de repetição e/ou chiado no peito;
3. Estenose de piloro - estreitamento na saída do estômago;
4. Atresia de duodeno - bloqueio na primeira porção do intestino;
5. Doença de Hirschsprung - dificuldade congênita para evacuar graças a ausência de nervos em uma parte do intestino;
6. Ânus imperfurado
7. Doença celíaca - diarréia, baixo peso e/ou baixa altura devido a "alergia" ao gluten da dieta
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